污水中微生物的主要種群是細(xì)菌、真菌、原生動(dòng)物、微型動(dòng)植物和病毒。大多數(shù)的微生物(細(xì)菌、原生動(dòng)物)對(duì)污水生物處理工藝是有益的，并且起著主要的作用。然而，污水中的一些病原菌、真菌、原生動(dòng)物和病毒卻因?qū)娊】涤泻Χ艿疥P(guān)注。
指示細(xì)菌污水中的致病病原體通常是由人類的腸道分泌而排放到污水中去的。水生的疾病包括霍亂、傷寒、副傷寒、腹瀉、痢疾等。污水中的致病病原體密度通常很低，很難分離和識(shí)別。因而，諸如總大腸桿菌、糞大腸桿菌和糞鏈球菌常用來作為指示生物。指示細(xì)菌的概念及細(xì)菌的計(jì)數(shù)方法在第1章已經(jīng)作了介紹。
總大腸桿菌、糞大腸桿菌和糞鏈球菌的計(jì)數(shù)方法有多管發(fā)酵法(最大可能數(shù)，MPN)或膜濾法，對(duì)這3類指示細(xì)菌所使用的測(cè)試介質(zhì)是不同的。由于糞大腸桿菌主要來自糞便殘?jiān)鄶?shù)管理機(jī)構(gòu)采用糞大腸桿菌的密度作為污水出水標(biāo)準(zhǔn)。
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